Kada glavnica korporacije S uplaćuje novac u posao, postoje znatno različite porezne posljedice ovisno o tome smatra li se plaćanje zajmom ili je klasificirana kao dodatni doprinos uplaćenog kapitala. Otplata zajma od korporacije S glavnici uglavnom se ne smatra dohotkom glavnice. Međutim, ako se početna uplata smatra dodatnim uplaćenim kapitalom, naknadne isplate glavnice mogu se smatrati raspodjelom dividendi ili plaća koje se tada oporezuju glavnici i mogu uključivati čak i porez na samozapošljavanje.
Za plaćanje glavnice korporaciji S koja se pravilno tretira kao zajam, Služba za unutarnje prihode ili IRS-a zahtijeva da postoji ugovor o obvezu duga između S korporacije i glavnice. Ako takav ugovor ne postoji, IRS se zajam može smatrati dodatnim uplaćenim kapitalom. Elementi ugovora o nepoštenom dugu uključuju stavke poput:
1) Pismeni ugovor ili mjenicu između korporacije S i naručitelja
2) razumnu kamatnu stopu na kredit
3) neke vrste osiguranja za zajam
4) Plan otplate zajma
Sveobuhvatna tema ovog određenja je istinski ugovor o zajmu, u kojem zajmodavac, koji je u ovom slučaju i glavni obveznik, ima sve uobičajene zaštite vanjskog zajmodavca. Ako takve zaštite ne postoje, sredstva se mogu smatrati "ugroženima". To je isto kao i sa svim drugim ulaganjima ili doprinosima u poslovno poduzeće. Iz perspektive korporacije S primanje sredstava glavnice trebalo bi klasificirati kao dug samo ako postoji pravi ugovor o dugu. U suprotnom, primljena sredstva prema zadanom trebaju biti evidentirana kao dodatni uplaćeni kapital.
Budući da su S korporacije protočni subjekti, porezni utjecaj neto dobiti ili gubitka tvrtke priznaje se na pojedinačnim poreznim prijavama ravnatelja. Ravnatelji su odgovorni za praćenje svoje osobne osnove i dugovanja u poslu. Gubici prolaženja korporacije mogu se oduzeti samo do iznosa osnovice u vlasništvu svakog glavnice. Suprotno tome, prolazni dohodak korporacije S veći od osnova smatra se oporezivim dohotkom. Iako korporacija S nije odgovorna za praćenje osnova dionica i duga svojih vlasnika, ipak bi trebala jasno razgraničiti kapitalne doprinose od zajmova kako bi financijski izvještaji na kraju godine bili tačni. Bilo kakve pogreške u financijskim izvještajima korporacije S mogu prouzrokovati da su K-1 izdani vlasnicima dionica netočni. Također je od vitalne važnosti da postoji jasna komunikacija između uprave S korporacije i glavnog koji korporaciji daje novac ili daje svoj zajam.
